Центр располагает современным лабораторным оборудованием для проведения широкого спектра исследований в области молекулярной биологии. Оборудование ЦКП «Геном» представлено уникальными системами высокопроизводительного секвенирования MiSeq (Illumina Inc, США), NextSeq 550 (Illumina Inc, США), iSeq 100 (Illumina Inc, США), генетическими капиллярными анализаторами 3500 (Applied Biosystems, США/Япония), системой для проведения цифровой капельной амплификации нуклеиновых кислот QX 200 (Bio-Rad, США), амплификаторами С1000 (Bio-Rad, США), спектрофотометром NanoDrop 8000 (Thermo Fisher Scientific, США), гомогенизатором лабораторным TissueLyser II (QIAGEN, Германия), системой очистки воды PURELAB FLEX 3 (Elga, Великобритания), генератором льда IMS-30 (Тесеус Лаб, Чехия), ПЦР-боксом, вортексом, шейкером, центрифугами и другим необходимым оборудованием для проведения пробоподготовок (ПЦР, NGS и др.).
Сотрудники ЦКП «Геном» оказывают практическую и консультативную помощь в проведении исследований на оборудовании как ученым Института, так и сторонними организациям.