Институт генетики и цитологии

Национальной академии наук Беларуси

Лаборатория молекулярных основ стабильности генома

Лаборатория создана в 1992 году д.б.н., профессором Р.И. Гончаровой на базе тематической группы антимутагенеза и мутагенов окружающей среды. В 2005 г. переименована в лабораторию генетической безопасности, а в 2017 г. – в лабораторию молекулярных основ стабильности генома. С декабря 2020 г. лабораторию возглавляет к.б.н., доцент Н.И. Рябоконь.

Руководитель: кандидат биологических наук, доцент
Рябоконь Надежда Ивановна
тел.: +375 (17) 252 71 35
e-mail: N.Ryabokon@igc.by

Услуги

Состав лаборатории

Рябоконь Надежда Ивановна, заведующий лабораторией, к.б.н., доцент

Гончарова Роза Иосифовна, главный научный сотрудник, д.б.н., профессор

Яцкив Анна Андреевна, старший научный сотрудник, к.б.н

Никитченко Наталья Васильевна, научный сотрудник

Синявская Елизавета Сергеевна, младший научный сотрудник

Шиманович Вячеслав Андреевич, младший научный сотрудник

Основные направления научных исследований

  • Изучение молекулярно-генетических основ целостности и устойчивости генома человека и животных в норме, при патологических состояниях и под воздействием различных факторов.
  • Анализ влияния изменчивости генома и эпигенома на общее и репродуктивное здоровье. Онкогеномика: комплексный анализ мутационной и эпигенетической изменчивости злокачественных опухолей.
  • Разработка молекулярно-генетических методов диагностики и выявления подтипов заболеваний, а также прогноза их возникновения и клинического течения.
  • Антимутагенез как важный путь поддержания целостности генома, стимуляции жизнеспособности и снижения риска заболеваемости.

Основные результаты

Впервые описана трансгенерационная геномная нестабильность в ряду поколений млекопитающих животных под влиянием хронического радиационного облучения.

Установлено влияние поли(ADP-рибозы) на скорость и эффективность эксцизионной репарации оснований ДНК (BER) после генотоксического воздействия.

Экспериментально обоснована гипотеза об антимутагенах как модуляторах защитных процессов организмов и, как следствие, стимуляторах приспособленности и продуктивности животных.

Разработан «Способ определения целостности генома лимфоцитов крови человека с помощью тестирования одиночных клеток методом ДНК-комет».

Получены новые данные о том, что в группах пациентов гомозиготное носительство аллелей дикого типа генов эксцизионной репарации нуклеотидов ERCC2/XPD и ERCC6/CSB способствует долгожительству, уменьшает предрасположенность к раку мочевого пузыря в старческом возрасте и снижает агрессивность течения этого заболевания.

Определены ключевые молекулярно-генетические изменения, характеризующие различные подтипы рака мочевого пузыря, и установлено их влияние на развитие отдаленных результатов лечения. Обнаружены потенциальные диагностические маркеры, позволяющие дискриминировать опухолевую и нормальную ткань мочевого пузыря с наибольшей чувствительностью и специфичностью. Выявлены маркеры прогрессирования рака мочевого пузыря и онкоспецифической выживаемости пациентов.

С использованием высокопроизводительного секвенирования (NGS) описан спектр герминальных мутаций и полиморфных вариантов генов репарации ДНК, ответственных за гомологичную рекомбинацию (BRCA1, BRCA2, ATM, CHEK2 и PALB2), у пациентов с метастатическим раком предстательной железы. Выявлены независимые прогностические факторы для общей выживаемости и ответа на лечение пациентов с указанным заболеванием.

Выявлен комплекс ДНК-маркеров предрасположенности к ювенильным аутоиммунным ревматическим заболеваниям (ювенильному идиопатическому артриту, ювенильной форме системной красной волчанки и болезни Кавасаки).

С использованием NGS проведен анализ полных последовательностей генов нефрина (NPHS1) и подоцина (NPHS2) у пациентов детского возраста с различными формами нефротического синдрома. Описана мутационная и полиморфная изменчивость этих генов в белорусской популяции. Выявлены ДНК-маркеры неблагоприятного прогноза нефротического синдрома.

Изучены уровни различных типов повреждений ДНК (одно- и двунитевых разрывов, окисленных оснований ДНК) в спермиях мужчин в норме и при пониженной фертильности.

Разработаны молекулярно-генетические технологии и алгоритмы, которые легли в основу инструкций по применению:

    • Метод определения вероятного развития ювенильных аутоиммунных ревматических заболеваний. Инструкция по применению. А.М. Чичко, Г.М. Батян, Е.В. Сечко, И.А. Козыро, И.Ю. Бакутенко, И.Д. Кужель, А.В. Сукало, Н.И. Рябоконь. МЗ РБ, Рег. № 082-0622 от 24.11.2022.
    • Метод прогнозирования выживаемости и риска метастазирования при мышечно-инвазивном раке мочевого пузыря. М.П. Смаль, А.И. Ролевич, Д.В. Большакова, Л.Н. Суслов, Т.И. Набебина, С.А. Красный, Р.И. Гончарова. МЗ РБ, Рег. № 099-1021 от 19.11.2021.
    • Алгоритм прогнозирования результатов лечения рака мочевого пузыря без мышечной инвазии. М.П. Смаль, А.И. Ролевич, Т.И. Набебина, С.А. Красный, С.Л. Поляков, Р.И. Гончарова. МЗ РБ, Рег. № 012-0319 от 25.04.2019.
    • Метод диагностики генетически обусловленных форм мужского бесплодия. О.В. Прибушеня, Е.И. Головатая, А.Л. Маркевич, Е.А. Требка, И.В. Наумчик, Н.И. Рябоконь, Н.В. Никитченко. МЗ РБ, Рег. № 196-1115 от 18.03.2016.
    • Метод оценки прогноза клинического течения рака мочевого пузыря на основе комплексного анализа клинико-морфологических и генетических параметров опухоли. А.И. Ролевич, М.П. Смаль, Т.И. Набебина, С.А. Красный, Р.И. Гончарова, С.Л. Поляков. МЗ РБ, Рег. № 121-1114 от 27.11.2014.

Публикации (за текущие 5 лет)

Всего более 90 публикаций, включая статьи в изданиях с высоким импакт-фактором:

  1. Leonova E., Ryabokon N., Rostoka E., Borisovs V., Velena A., Bisenieks E., Dzintare M., Goncharova R., Sjakste N. Genotoxic and genoprotective effects of 1,4-dihydropyridine derivatives: a brief review // Archives of Industrial Hygiene and Toxicology. – 2023. – V. 74. – P. 1–7 (Scopus: IF=2,6)
  2. Bakutenko I.Y., Haurylchyk I.D., Sechko E.V., Tchitchko A.M., Batyan G.M., Sukalo A.V., Ryabokon N.I. AGER gene variant as a risk factor for juvenile idiopathic arthritis // J. Gene Medicine. – 2022. – V. 24, № 2. – e3399 (Scopus: IF=4,2)
  3. Bakutenko I.Y., Haurylchyk I.D., Nikitchenko N.V., Sechko E.V., Kozyro I.A., Tchitchko A.M., Batyan G.M., Sukalo A.V., Ryabokon N.I. Neutrophil cytosolic factor 2 (NCF2) gene polymorphism is associated with juvenile-onset systemic lupus erythematosus, but probably not with other autoimmune rheumatic diseases in children // Mol. Genet. Genomic Med. – 2022. – V. 10, № 1. – e1859 (Scopus: IF=2,2)
  4. Shilkin E.S., Gromova A.S., Smal M.P., Makarova A.V. DNA Polymerase and dRP-lyase activities of polymorphic variants of human Pol ι // Biochem. J. – 2021. – V. 478, №7. – P. 1399–1412 (Scopus: IF=4,1)
  5. Arslan M., Gulen S., Tacer-Tanas S., Yanik T., Gurdal A., Kocaman M., Atasever A., Slukvin A., Goncharova R. Long-term dietary diludine (diethyl 1,4-dihydro-2,6-dimethyl-3,5-pyridinedicarboxylate) intake and gamete storage affect α-tocopherol status and reproductive performance in female rainbow trout, Oncorhynchus mykiss // Aquaculture. – 2021. – V. 533. – P. 1–6 (Scopus: IF=4,1)
  6. Shilkin E.S., Boldinova E.O., Stolyarenko A.D., Goncharova R.I., Chuprov-Netochin R.N., Khairullin R.F., Smal M.P., Makarova A.V. Translesion DNA synthesis and carcinogenesis // Biochemistry (Moscow). – 2020. – V. 85, № 4. – P. 425–435 (Web of Science: IF=1,98)

Участие в конференциях (за текущие 5 лет)

Участие в более чем 40 международных и республиканских конференций, в т.ч. с 12 устными докладами, включая

  • Республиканскую междисциплинарную конференцию с международным участием «Молекулярная диагностика в онкологии» (14.05.2019, г. Минск);
  • IV Международную научную конференцию «Генетика и биотехнология XXI века: проблемы, достижения, перспективы» (3-4.11.2020, г. Минск);
  • V Российский конгресс с международным участием «Молекулярные основы клинической медицины – возможное и реальное» (26-29.03.2020, г. С.-Петербург, РФ);
  • 12th International Multiconference “Bioinformatics of Genome Regulation and Structure / Systems Biology” (6–10.07.2020, г. Новосибирск, РФ);
  • Международный семинар «Технологии высокопроизводительного секвенирования (NGS): опыт и возможности применения в медицинской генетике» (17.03.2021, г. Минск);
  • Международный научный семинар «Роль генетических исследований в современной диагностике и лечении заболеваний» (23.03.2022, г. Минск);
  • Joint EEMGS meeting & International Comet Assay Workshop (May 23rd–26th 2022, Maastricht, the Netherland);
  • V Международную научную конференцию «Генетика и биотехнология XXI века: проблемы, достижения, перспективы» (21-25.11.2022, г. Минск)

Научное руководство (за текущие 5 лет)

Защищена 1 кандидатская диссертация, выполнены 1 магистерская работа, 1 дипломная и 2 курсовые студенческие работы.

Награды, гранты

  • Стипендия Президента Республики Беларусь талантливым молодым ученым (2023 г.) – к.б.н. Яцкив А.А.
  • Грант Международного союза по борьбе с раком (2022 г.) – к.б.н. Смаль М.П.
  • Премия НАН Беларуси имени академика В.Ф. Купревича для молодых ученых НАН Беларуси (2021 г.) – к.б.н. Яцкив А.А. за цикл работ «Молекулярная изменчивость генов иммунного ответа при ювенильном идиопатическом артрите у детского населения Республики Беларусь».